Compilers

  • GCC Compilers 4.93, 5.10, 5,20
  • CMake 3.4.3
  • OpenMPI Compilers 1.6.5,1.8.1, 1.8.2, 1.8.4, 1.10.2, 2.0.1
  • MPICH 3.1.4, 
  • MVAPICH 1.2rc1
  • CUDA 5.5.22

Statistics

  • R 3.13, 3.2.5
  • STATA 14
  • Matlab R2016A
  • Mathematica 10.4.1

Languages

  • PERL 5.22.1
  • Python 2.7.9, 3.4.3
  • R 3.1.2, 3.2.5
  • GO 1.4.2

Data

  • HDF5 1.6.10, 1.8.12, 1.8.14-1, 1.8.15-patch1-1, 1.8.16
  • NetCDF 4.2, 4.3.3.1, 4.4.0
  • NetCDF Operators (NCO) 4.6.0
  • CDO Climate Data Operators 1.6.8
  • SQLite 3.9.2

Visualization

  • Visit 2.10.3
  • Ncview 2.1.2
  • Rstudio 0.98.1103

Engineering

  • Star CCM+ 9.04.009, 9.06.11
  • PEET-Particle 1.10.0
  • Matlab R2016a
  • Mathematica 10.4.1

Bioinformatics

  • Mothur 1.36.1
  • NCBI BLAST 2.2.30+,  2.3.0+
  • Usearch 32bit 8.0.1623
  • BEAST 1.8.2
  • Beagle 2.1.2
  • Bowtie 2.2.7
  • Fastqc 0.11.4
  • Jags 4.1.0
  • kClust
  • SIFT 0.4.1
  • CD-HIT 4.6.5
  • Clustal Omega 1.2.1
  • HMMER 3.1b2
  • RELION 1.4-beta-9

Libraries

  • boost 1.58.0
  • blas 3.5.0
  • lapack 3.5.0
  • linpack 11.3.0.004
  • netperf 2.6.0
  • ScaLAPACK 1.8.0, 2.0.2
  • xxHash r39
  • zbackup 1.4.1
  • autoconf 2.69
  • Automake 1.15
  • Bison 3.0.4
  • bzip2 1.0.6
  • Doxygen 1.8.11
  • M4 1.4.16, 1.4.17
  • ncurses 5.9, 6.0
  • FFTW 3.3.4
  • flex 2.5.39, 2.6.0
  • GMP 6.1.0
  • gompi 1.7.20,
  • hwloc 1.10.1, 1.11.2, 1.8, 1.8.1, 1.9
  • TCL 8.6.4
  • libreadline 6.3.
  • libtool 2.4.5, 2.4.6
  • zlib 1.2.8,
  • mdtest 1.9.3
  • numactl 2.0.9, 2.0.10, 2.0.11
  • OpenBLAS 0.2.13, 0.2.14, 0.2.15
  • Szip 2.1
  • Tk 8.64